大事記

整理工作的起步
全面性的清查
大規模的整理
數位化的開展
徐中舒主持民國18年自李盛鐸手中購入，於北平午門西翼樓進行去灰、鋪平、裱褙，以及初步的分類整理
民國19年出版《明清史料》甲編
出版《清代官書記明臺灣鄭氏亡事》
民國21年完成重要檔案簡明目錄
民國22年出版《內閣大庫書檔舊目》
民國24年出版《明清史料》乙、丙編
民國26年抗日戰爭爆發，檔案擇要百箱南運，輾轉遷徙長沙、昆明、四川李莊、南京等地
民國37年《明清史料》丁編稿存上海，未及付印

[註]
據民國六十一年出版書籍的版權頁：
民國61年2月再版，出版者：中央研究院歷史語言研究所員工福利委員會

據民國八十八年出版書籍的版權頁：
民國四十年十一月出版，民國八十八年九月景印二版，出版者：中央研究院歷史語言研究所(於本年後註記：民國四十年在臺出版)
民國38年檔案運抵臺灣
李光濤主持民國40年清點運臺百箱檔案，共計311914件
民國42年出版《明清史料》戊編，至56年陸續發行己、庚、辛、壬、癸諸編
民國48年出版《明清檔案存真選輯》初集
民國59年出版《清太祖朝老滿文原檔》一
民國60年出版《清太祖朝老滿文原檔》二
民國62年出版《明清檔案存真選輯》二集
民國64年出版《明清檔案存真選輯》三集
張偉仁主持民國70年檔案鈐印編號，影印複本，原件封存上架，影本則供出版、研究之用
民國75年與聯經出版公司合作出版《明清檔案》
（共發行12輯，第 1-10輯為書版，計324冊，第11-12輯為光碟版）
劉錚雲主持 (84年～90年)
何漢威主持 (90年～92年)
陳國棟主持 (92年～94年)
劉錚雲主持 (94年～101年)
陳熙遠主持 (101年～迄今)		民國84年撰寫檔案後設資料，建置內閣大庫檔案資料庫
民國85年停止影印檔案原件，改採影像掃描與數位攝影方式保存檔案數位化影像
民國86年出版《臺灣史檔案文書目錄》第十三冊
民國87年建置「內閣大庫檔案」網頁，開放檔案內容提要線上檢索
民國90年擴增內閣大庫檔案資料庫的影像安全控管系統，開放國內線上閱覽與全文影像列印服務
民國91年參與行政院國家科學委員會資助之「國家數位典藏計畫」，配合本所「珍藏文物數位典藏子計畫」分項計畫五「內閣大庫檔案」，加速內閣大庫檔案數位化之進程，並協助建置「人名權威檔」與「地名權威檔」。
民國96年配合「國家數位典藏計畫」下，本所主持之「史語所數位知識總體經營計畫–拓展台灣數位典藏」分支五「史語所藏明清檔案數位知識網絡」，進行卷軸類檔案之數位化工作，並協助擴增明清歷史人物傳記資料，以及明清歷史動態地圖資訊系統、清代職官資料庫之建置。
民國100年整合本所內閣大庫檔案、近史所外交檔案，以及國立故宮博物院之清代宮中檔奏摺及軍機處檔摺件，建置跨資料庫整合檢索平台。
民國101年擴增「內閣大庫檔案」系統，將檔案檢索介面改以知識庫架構呈現。
出版《內閣大庫檔案臺灣史料彙編》
民國105年出版《皇帝的第一道與最後一道命令》
民國108年
出版《天朝大慶：皇清盛典》